据说，整个屠杀行动是由成吉思汗的女儿，也就是脱忽察儿的老婆指挥的。这位刚经历丧夫之痛的女人下令屠城后，又把已死百姓的头颅区分为男人、女人和孩童，堆进三个不同的金字塔内。随后，她又下令处死城内的猫、狗以及其他一切有生命的动物，据说，这样一来，就再也没有有生命的动物可存活下来伤害她的丈夫了。
把你沙不儿城变成废墟后，拖雷分兵一支去攻击呼罗珊地区的次要城市，而他本人则统帅主力军，向东进发，围攻今阿富汗西北部的名城也里（今阿富汗赫拉特）。也里城是中亚、南亚同西亚各地区交通、贸易的枢纽，战略位置相当重要。拖雷派人到城中劝降，也里城守将给的答案是杀掉拖雷的使者，把人头扔出城外，同时勉励守军死守，不是为摩诃末，而是为了也里城的尊严。
拖雷只好付诸强攻，攻击八日，也里城屹立不倒。但在蒙古人的强大攻势面前，也里城一部分守军已意志涣散，拖雷得到此消息后，第二次派人进城劝降，并向也里守将承诺，只要投降，即可免全城生灵涂炭。也里守将相信了拖雷，开城门投降。拖雷没有信守承诺，将守军一万余人全部屠杀，不过他也信守了承诺，没有屠杀也里城的百姓。